分析DNA數(shù)據(jù)與臨床信息以縮短確定治療方案的時間
IBM公司3月19日表示,他們將利用其超級計算機“沃森”的云計算系統(tǒng)與位于紐約的基因組研究中心合作,幫助開發(fā)治療腦膠質(zhì)瘤的方案,以期戰(zhàn)勝人類腦癌。
紐約基因組中心是一個集研究、醫(yī)療和產(chǎn)業(yè)于一體的非盈利性集團。他們將對腦膠質(zhì)瘤病人進行DNA測序,然后用“沃森”把這些數(shù)據(jù)和臨床信息結(jié)合起來,幫每個病人確定最佳的治療方案,作為臨床試驗的一部分。該中心總裁、首席執(zhí)行官兼科學部主管羅伯特·達內(nèi)爾說:“一旦你得了腦膠質(zhì)瘤,時間就不多了,這時是‘沃森’發(fā)揮作用的時候。”
據(jù)物理學家組織網(wǎng)稱,“沃森”的獨特之處在于,它會通過“閱讀”大量信息來學習,并把這些信息和以前所學結(jié)合起來,找到問題的答案。這種特征讓“沃森”非常適合處理衛(wèi)生保健、金融等領域那些數(shù)據(jù)量極大的工作。
IBM高級副總裁與研究主管約翰·凱利說,DNA測序中將產(chǎn)生大量數(shù)據(jù),必須把這些數(shù)據(jù)和某個特定病人的所有臨床數(shù)據(jù)相結(jié)合,由此產(chǎn)生的數(shù)據(jù)庫非常巨大,用人工來處理是不可能的。凱利說:“這就像在草垛里尋針,而且這個草垛極為巨大。人類花幾年時間來做的事,‘沃森’只要幾秒鐘就能完成。”
達內(nèi)爾表示,希望“沃森”能給醫(yī)生帶來幫助,大大縮短確定一個病人治療方案的時間。例如,如果“沃森”確定在一例兒童白血病中有類似于黑色素瘤的基因特征,使用黑色素瘤藥物有可能成功縮小該兒童的腫瘤。雖然由頂級醫(yī)生和研究人員組成的團隊也能做到,但他們確定的速度會比較慢,也沒有足夠的專家資源來幫助每個病人。而“沃森”有升級的潛力,有望幫助更多病人。
此次合作的時機也很恰當,正值IBM在不斷提高他們對“沃森”及其他云計算基礎的軟件服務的關(guān)注,而對其計算機硬件的關(guān)注進一步下降。今年初,IBM宣布將投資10億美元成立沃森商業(yè)分部,總部設在紐約。此外,位于紐約的IBM阿蒙克公司已經(jīng)與紀念斯隆-凱特琳癌癥中心合作,也用“沃森”來幫助癌癥治療。
腦膠質(zhì)瘤是美國成年人中最常見的一種腦癌,這是一種極具侵略性的癌癥,中間生存率只有12個月至14個月,每年死于這種癌癥的病人約13000人。參加這一計劃的醫(yī)生希望以計劃的20位腦癌患者為開始,對他們的DNA測序,然后通過“沃森”運行這些信息,為他們找到一條治療疾病的最佳途徑。