NEC日前發(fā)布了采用AI預(yù)測(cè)技術(shù)的基因分析結(jié)果，用于設(shè)計(jì)可促進(jìn)全球多數(shù)人群T細(xì)胞反應(yīng)(注1)的SARS-CoV-2(新型冠狀病毒)疫苗。本成果旨在幫助防止新型冠狀病毒感染癥"COVID-19"感染擴(kuò)大，并支援全球疫苗開(kāi)發(fā)，由NEC OncoImmunity AS(注2)與NEC歐洲研究所合作成立的研究團(tuán)隊(duì)所取得。本研究應(yīng)用了NEC與NEC OncoImmunity在個(gè)體化癌癥疫苗開(kāi)發(fā)中使用的AI預(yù)測(cè)技術(shù)。
論文網(wǎng)站"bioRxiv"上發(fā)表的研究結(jié)果顯示，分析數(shù)千種SARS-CoV-2的基因組序列，鎖定了全球人群中最經(jīng)常被找到的100個(gè)HLA等位基因(多種免疫型)的表位(可作為疫苗靶點(diǎn))。
具體來(lái)說(shuō)，不僅使用預(yù)測(cè)算法分析了作為冠狀病毒名稱起源的表面刺突蛋白，還分析了SARS-CoV-2的全部蛋白，根據(jù)所得數(shù)據(jù)，對(duì)多個(gè)HLA等位基因型鎖定"熱點(diǎn)（Hot Spot）"，該"熱點(diǎn)"重復(fù)包含了SARS-CoV-2蛋白中的共通表位。另外，充分采用本算法，優(yōu)先選定了全球人群覆蓋最廣、且病毒蛋白中變異較少、今后也很難發(fā)生變異的保存區(qū)域中獲得的最佳熱點(diǎn)組。并且，為確保安全性，除去了病毒表位中與人類蛋白相似度高、特別是在重要臟器中發(fā)現(xiàn)的熱點(diǎn)。
本成果的分析結(jié)果展示了對(duì)世界多數(shù)人群安全有效、且亦能應(yīng)對(duì)現(xiàn)在和將來(lái)的病毒多樣性的疫苗設(shè)計(jì)，同時(shí)也體現(xiàn)了NEC集團(tuán)AI預(yù)測(cè)技術(shù)的技術(shù)水平高度。
在公開(kāi)本次研究成果、支援科學(xué)進(jìn)步的同時(shí)，NEC將開(kāi)啟以加快疫苗開(kāi)發(fā)為目的的合作活動(dòng)。
NEC常務(wù)執(zhí)行董事兼首席技術(shù)官西原基夫表示："很高興NEC的AI技術(shù)能夠?yàn)楫?dāng)今世界面臨的嚴(yán)重問(wèn)題做出貢獻(xiàn)。在世界各國(guó)都在為解決這一艱難課題而努力的情況下，NEC作為企業(yè)公民也有責(zé)任和義務(wù)參與到這一行動(dòng)中。我們將以此次研究為開(kāi)端，最大限度地活用AI技術(shù)這一NEC集團(tuán)的優(yōu)勢(shì)，與各種各樣的企業(yè)和機(jī)構(gòu)合作，抑制新型冠狀病毒感染癥的擴(kuò)大，為了讓全球的人們能夠盡早恢復(fù)日常生活而努力。"
NEC OncoImmunity的首席科學(xué)家Trevor Clancy博士表示："敝公司首席執(zhí)行官Richard Stratford博士和其團(tuán)隊(duì)以及NEC集團(tuán)，對(duì)于我們針對(duì)個(gè)體化癌癥免疫療法的機(jī)器學(xué)習(xí)軟件'NEC Immune Profiler'從現(xiàn)在投入的癌癥領(lǐng)域迅速適應(yīng)感染癥領(lǐng)域，并能夠?yàn)樾滦凸跔畈《靖腥景Y的應(yīng)對(duì)提供支持，感到非常振奮。我們的AI和生物信息平臺(tái)，不僅可以守護(hù)全球人類，而且對(duì)于現(xiàn)在和將來(lái)可能發(fā)生的新型冠狀病毒的多種變異版本，還能夠設(shè)計(jì)出可引發(fā)以長(zhǎng)期記憶免疫反應(yīng)等廣泛免疫反應(yīng)的疫苗，這是一種很大的鼓勵(lì)。"
NEC歐州研究所數(shù)據(jù)科學(xué)與系統(tǒng)平臺(tái)部門總經(jīng)理Saverio Niccolini博士表示："我們?cè)臼菫轭A(yù)測(cè)各個(gè)癌癥患者的免疫反應(yīng)而設(shè)計(jì)的算法，應(yīng)用到了大規(guī)模的感染癥群體。我們算法中的計(jì)算機(jī)驗(yàn)證(in silico驗(yàn)證)考慮到了人類在整個(gè)大陸的遺傳背景。目前，全球正受到日益擴(kuò)大的新型冠狀病毒感染癥的威脅，我們的成果顯示了為阻止這一威脅的全球舉措做出貢獻(xiàn)的可能性，這是非常重要的。我們已開(kāi)始與合作伙伴就wet-lab實(shí)驗(yàn)進(jìn)行協(xié)商，正在為開(kāi)發(fā)出對(duì)全球多數(shù)人群有效的疫苗而邁出重要的一步。"
論文信息
標(biāo)題：
Artificial intelligence predicts the immunogenic landscape of SARS-CoV-2： toward universal blueprints for vaccine designs
作者：
Brandon Malone， Boris Simovski， Clément Moliné， Jun Cheng， Marius Gheorghe， Hugues Fontenelle， Ioannis Vardaxis， Simen Tenn？e， Jenny-Ann Malmberg， Richard Stratford， Trevor Clancy
摘要URL：
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.21.052084v1
(注1)T細(xì)胞反應(yīng)：T細(xì)胞是白血球中的一種免疫細(xì)胞，激活T細(xì)胞的反應(yīng)為T細(xì)胞反應(yīng)。
(注2)總部：挪威奧斯陸、CEO：Richard Stratford。
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