CTI論壇（ctiforum）8月21日消息（記者 李文杰）: 日前，國(guó)家食藥總局批準(zhǔn)了兩款基因測(cè)序儀及檢測(cè)試劑盒，這是自政府出臺(tái)“二月禁令”后，首次批準(zhǔn)基因測(cè)序技術(shù)可以進(jìn)行臨床應(yīng)用，政府政策的松綁引發(fā)了大批資本對(duì)該市場(chǎng)的覬覦。據(jù)統(tǒng)計(jì)，2013年中國(guó)對(duì)于測(cè)序儀及試劑的投入總額超過20億元，中國(guó)龐大的市場(chǎng)蛋糕早已引發(fā)基因測(cè)序廠商的高度重視。

　　近日，浪潮為國(guó)產(chǎn)基因測(cè)序儀廠商中科紫鑫設(shè)計(jì)構(gòu)建了高性能計(jì)算集群，用于提供面向全國(guó)的基因測(cè)序分析云服務(wù)。據(jù)悉該集群將可承擔(dān)20到40臺(tái)新一代國(guó)產(chǎn)自主基因測(cè)序儀在全國(guó)范圍試運(yùn)行期間的所有測(cè)序分析服務(wù)。

　　人類基因是一種非常重要的戰(zhàn)略性資源，不能單從資本利益來衡量其價(jià)值。從20世紀(jì)90年代“人類基因組工程”計(jì)劃啟動(dòng)之日起，美國(guó)、日本和歐洲等國(guó)家已經(jīng)意識(shí)到人類基因的戰(zhàn)略地位并搶先紛紛注冊(cè)基因?qū)＠�，所以誰(shuí)擁有最多的人類基因誰(shuí)就能在未來基因診斷、基因醫(yī)療技術(shù)方面擁有絕對(duì)話語(yǔ)權(quán)。而對(duì)于13億人口大國(guó)的中國(guó)來說，擁有自主研發(fā)基因測(cè)序儀技術(shù)和產(chǎn)品將成為未來中國(guó)基因產(chǎn)業(yè)發(fā)展的必由之路。

　　中科紫鑫是紫鑫藥業(yè)和中科院北京基因組研究所在技術(shù)研發(fā)合作框架下成立的獨(dú)立公司，致力于研制開發(fā)我國(guó)自主基因測(cè)序技術(shù)，其研發(fā)的國(guó)產(chǎn)新一代基因測(cè)序儀是國(guó)內(nèi)目前唯一一個(gè)技術(shù)性能可以匹敵國(guó)際市場(chǎng)主流產(chǎn)品的國(guó)產(chǎn)基因測(cè)序系統(tǒng)，其測(cè)序長(zhǎng)度（讀長(zhǎng)）達(dá)到500-1000bp,為目前二代測(cè)序儀中最高水平。

　　基因測(cè)序技術(shù)應(yīng)用需要對(duì)海量、復(fù)雜、多變的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析計(jì)算，因此需要高性能計(jì)算機(jī)來進(jìn)行基因數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)和分析。每個(gè)人有23對(duì)染色體，這些染色體中包含的DNA由ATCG不同堿基序列構(gòu)成，數(shù)量共計(jì)達(dá)30億。對(duì)人進(jìn)行全基因組測(cè)序產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù)，必須通過高性能計(jì)算機(jī)來進(jìn)行處理分析才能得到對(duì)個(gè)體醫(yī)療診斷分析有益的結(jié)果。

　　據(jù)專業(yè)人士介紹，基因測(cè)序分析對(duì)高性能計(jì)算機(jī)的計(jì)算性能、內(nèi)存容量、數(shù)據(jù)帶寬等要求很高，同時(shí)還必須支持完善的基因測(cè)序分析工作流。浪潮為中科紫鑫設(shè)計(jì)構(gòu)建的高性能計(jì)算集群是專門針對(duì)基因測(cè)序應(yīng)用定制設(shè)計(jì)的專用機(jī)。專用機(jī)采用了刀片服務(wù)器、胖節(jié)點(diǎn)作為計(jì)算平臺(tái)，并行存儲(chǔ)系統(tǒng)用于提升數(shù)據(jù)帶寬，采用萬兆網(wǎng)絡(luò)提升通訊效率，并充分考慮了應(yīng)用特點(diǎn)定制開發(fā)了基因測(cè)序工作流軟件。

　　浪潮近年來一直在生命科學(xué)領(lǐng)域高性能計(jì)算進(jìn)行持續(xù)的技術(shù)和應(yīng)用投入，目前在國(guó)內(nèi)外擁有眾多的生命科學(xué)典型案例。浪潮聯(lián)手中央電視臺(tái)拍攝了《走進(jìn)科學(xué)》超算系列片，對(duì)高性能計(jì)算在基因方面的應(yīng)用進(jìn)行了全面介紹。除高性能計(jì)算硬件系統(tǒng)設(shè)計(jì)供應(yīng)能力外，浪潮還擁有一支專業(yè)的應(yīng)用專家團(tuán)隊(duì)，在對(duì)生命科學(xué)應(yīng)用支持以及對(duì)GPU、MIC等新型架構(gòu)移植優(yōu)化取得了顯著效果。浪潮與中科院聯(lián)合研發(fā)的基于MIC平臺(tái)的生命科學(xué)應(yīng)用軟件ATOM，在全球超算大會(huì)SC上作為世界5個(gè)MIC成果之一進(jìn)行了展示。